История основания поселка Хамышки уходит в глубь веков. До нас дошли только некоторые сведения со времен Кавказской войны. В 1862 году, после длительных зимних боев с черкесами в неприступном ущелье Хаджоха царские войска под командованием полковника Геймана 26 апреля вошли в Даховскую котловину.
Впереди были глухие, скальные, неприступные ущелья, в которых боевые действия с горцами продолжались до глубокой осени. Лишь только 14 декабря Даховский отряд начал поход на Хамышинском направлении и 20 декабря заложил военное укрепление Хамышки.
В мае 1866 года укрепление упразднили, а в марте 1868 года основали село Хамышки.
Как память о тех суровых годах, в Хамышках сохранилась тяжелая чугунная плита с надписью: „Здесь покоится тело убитого горцами штабс-капитана Григория Дмитриевича Назарова, родившегося 1836 году, а убитого 25 июня 1868 года. Памятник в год сооружен женой его Анною и дочерью Елизаветою Назаровыми. 1869 год".
Назывались Хамышки еще и селом Алексеевским, в честь наследника престола царевича Алексея.